Une nouvelle étude examine les microbiomes canins

image: La plupart des études ont porté sur les microbiomes chez les chiens dans les centres vétérinaires, qui sont très différents des chiens qui ne vivent pas comme animaux de compagnie.
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Bien que le microbiome – l’ensemble des microbes qui vivent dans le corps – ait été largement étudié dans les matières fécales des chiens, ces études se sont principalement limitées aux chiens domestiques. Dans une nouvelle étude, des chercheurs ont échantillonné des microbiomes de selles dans différentes populations géographiques pour mieux comprendre à quoi ils ressemblent dans le monde.

“De nombreuses études ont examiné comment différents régimes affectent les microbes chez les chiens. Bien qu’elles soient approfondies, elles travaillent avec des chiens dans des centres vétérinaires qui vivent très différemment des chiens qui ne vivent pas comme animaux de compagnie”, a déclaré Karthik Yarlagadda, ancien diplômé du groupe Malhi. La recherche sur les microbiomes humains s’est concentrée sur les personnes vivant dans les villes et consommant des aliments transformés.”

Pour échantillonner différents microbiomes, les chercheurs ont collecté des excréments dans trois zones géographiques : des animaux domestiques d’Afrique du Sud, des chiens errants et des chiens de refuge en Inde, et des chiens d’un village rural du Laos. Des échantillons ont été prélevés sur des cartes FTA contenant des produits chimiques qui conservent l’ADN pour un séquençage et une analyse ultérieurs.

“La plupart de nos recherches précédentes ont porté sur des animaux qui viennent dans une clinique vétérinaire ou sont gardés dans un centre de recherche ; ils sont vaccinés et mangent des aliments transformés”, a déclaré Kelly Swanson, professeur de sciences animales et de nutrition, exposée à un environnement différent. . En faisant ces études, nous pouvons découvrir ce qui est considéré comme “normal” pour différentes populations à travers le monde.

Les chiens avaient un régime alimentaire différent à chaque endroit. Les chiens de refuge ont été nourris avec du riz, des lentilles, du yaourt et de la nourriture pour chiens; les chiens errants étaient susceptibles d’attraper des restes humains; les chiens du village consommaient des produits agricoles locaux, notamment du maïs, du maïs, du bambou, du riz gluant et du poisson des rivières voisines ; et les animaux de compagnie étaient probablement nourris avec de la nourriture commerciale pour chiens.

Fait intéressant, bien que les microbiomes de différentes populations diffèrent, ils étaient fonctionnellement identiques. “C’était cool de voir que vous pouvez avoir différents microbiomes, mais qu’ils remplissent tous la même fonction métabolique. Par exemple, les chiens qui consommaient des produits laitiers dans les populations sud-africaines et indiennes avaient différents Lactobacille espèces qui étaient susceptibles d’être sur la même voie », a déclaré Yarlagadda.

En plus de comparer les microbiomes de chiens de différentes zones géographiques, les chercheurs voulaient-ils le faire ? comparez ces échantillons avec d’anciens microbiomes obtenus à partir d’excréments de chien durcis. On pense que les chiens d’extérieur et mixtes ont des microbiomes similaires à ceux des chiens anciens, ce qui donne un aperçu de la façon dont l’industrialisation affecte les microbes fécaux.

En effet, les chercheurs ont observé que les microbiomes des chiens anciens étaient très similaires à ceux des populations non américaines, ce qui peut être dû à des régimes qui se chevauchent et à un impact environnemental plus important. D’autres travaux détermineront si la diversité du microbiome humain dans des conditions non industrielles suit des tendances similaires.

“En utilisant les méthodes de séquençage de l’étude précédente, nous voulons trouver plus de données sur les microbiomes anciens chez différentes espèces de chiens”, a déclaré Ripan Malhi, professeur d’anthropologie (GNDP/GSP/IGOH). “Parce que nous savons en quoi consistait leur alimentation, nous pouvons faire plus de comparaisons pour voir comment l’alimentation affecte le microbiome.”

L’étude “Geographically Diverse Dog Samples Provide a Novel Overview of Industrial Microbiomes” a été publiée dans. Actes de la Royal Society B: Sciences biologiques et peut être trouvé au 10.1098 / rspb.2022.0052. L’étude a été financée par le Département de l’agriculture des États-Unis et l’Université de l’Illinois à Urbana-Champaigni.


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