Découverte de nouvelles espèces végétales et fongiques

Échantillon d’algues dans l’album de découpe d’algues de Charles Morrison. Crédit : Herbier de l’Université de Melbourne

Nous ne savons pas encore grand-chose sur les espèces indigènes d’Australie et de Nouvelle-Zélande. Les meilleures estimations montrent que nous devons encore découvrir et nommer environ 70% de la vie qui nous entoure.

L’image de la vie des plantes est probablement la plus complète – nous estimons que nous avons trouvé et décrit 90% des plantes vasculaires (telles que les plantes à fleurs, les graines et les fougères), mais même cela suggère que peut-être plusieurs milliers d’espèces végétales supplémentaires peuvent être trouvées.

Cependant, en ce qui concerne les champignons, nous avons décrit moins d’un quart des 100 000 espèces estimées.

Il est essentiel de mieux comprendre la biodiversité des plantes et des champignons indigènes. Nos plantes et champignons locaux sont une ressource vitale, y compris la nourriture, les médicaments et les produits matériels. Cette biodiversité est importante :

  • assurer la sécurité alimentaire grâce à une agriculture durable
  • développement de nouveaux médicaments
  • contrôle des agents pathogènes chez les espèces économiquement importantes telles que les cultures
  • et le maintien d’écosystèmes qui soutiennent d’autres espèces.

Mais le défi n’est pas seulement de découvrir, nommer et décrire de nouvelles espèces. Il est également nécessaire de veiller à ce que les données sur ces espèces (par exemple, dans quels habitats elles se trouvent ou dans quelles conditions climatiques elles poussent) soient librement disponibles afin que le public, les chercheurs et les décideurs politiques puissent utiliser ce que nous savons à leur sujet.

Et c’est là que les scientifiques citoyens font la différence.

Les herbiers australiens, qui sont des collections naturelles de plantes et de champignons, comme l’herbier de l’Université de Melbourne, conservent plus de huit millions de spécimens de plantes vasculaires, d’algues vertes et rouges, de mousses et de champignons.

Les données de collecte liées à ces échantillons, qui enregistrent le lieu et l’heure de la collecte des échantillons et, entre autres, leur collecte, sont les principales données sur la biodiversité qui seront rendues publiques via le référentiel en ligne Australasian Virtual Herbarium.

Ces données peuvent être utilisées dans la recherche, l’enseignement, la surveillance de la biodiversité, la biosécurité et de nombreuses autres applications.

À ce jour, seule une fraction des exemplaires de ces collections a été entièrement numérisée (y compris la création de bases de données, d’indications géographiques et d’imagerie numérique), ce qui est essentiel pour le partage et la réutilisation de ces données. C’est une entreprise énorme – et les chercheurs citoyens sont cruciaux.

Les initiatives citoyennes impliquent une variété de communautés locales dans la documentation de la biodiversité locale et la collecte de données sur la biodiversité basées sur la collecte. Leur implication s’appuie sur les connaissances locales, crée un réseau mondial de contributeurs aux efforts de numérisation et favorise la compréhension publique de la science de la biodiversité.

Par exemple, à l’herbier de l’Université de Melbourne, une équipe de bénévoles de premier cycle et de cycles supérieurs consacre du temps chaque semaine à la conservation, chaque semestre, y compris pendant la fermeture de toute la pandémie de COVID-19.

Découverte de nouvelles espèces végétales et fongiques

Le travail sur le terrain, comme la flore alpine dans les Alpes Victoria, est une partie importante de l’effort pour comprendre pleinement la biodiversité de nos plantes et champignons. Crédit : Dre Joanne Birch

Ces étudiants recevront une formation sur la préparation, la conservation, la numérisation et l’utilisation d’échantillons d’herbier dans la recherche scientifique, ainsi que sur les protocoles actuels de gestion des données sur la biodiversité.

De nombreux étudiants bénévoles obtiennent leur diplôme, d’autres assument un rôle de conservateur dans un herbier ou un musée, ou travaillent dans la gestion des données ou la bioinformatique.

En découvrant et en développant leurs intérêts de recherche et leurs compétences, ils apportent une contribution importante à la conservation de notre collection.

Les scientifiques citoyens sont à bien des égards l’équivalent moderne des « botanistes amateurs » du début du XXe siècle, à qui la botanique moderne doit beaucoup. L’un de ces “amateurs” australiens était le “botaniste scolaire” Herbert Bennett Williamson, qui a pris sa retraite de 1929 à 1931 en tant que steward à l’Université de Melbourne.

Tout au long de sa carrière d’enseignant professionnel (1875-1925), HB Williamson a migré à travers Victoria, observant la flore indigène, décrivant de nombreuses espèces et collectant plus de 6 000 spécimens qui ont fourni un herbier national et international – désormais accessible dans le monde entier.

En Australie, iNaturalist est une plate-forme populaire permettant aux scientifiques citoyens de contribuer aux données sur la biodiversité et compte plus de 27 000 utilisateurs. La portée des initiatives iNaturalist varie énormément, des initiatives locales ou spécifiques à une espèce – telles que FungiSight se concentrant sur les champignons australiens – à des initiatives mondiales telles que le Great Southern Bioblitz 2021, qui implique plus de 6 000 personnes.

Ces initiatives scientifiques communautaires fournissent des données à une échelle spatiale et temporelle qui ne sont pas possibles à partir d’individus ou de petits groupes de collectionneurs.

Les données conservées au niveau de la recherche provenant de ces référentiels fournissent une riche source de données d’observation, documentant où les espèces se trouvent et à quels écosystèmes elles appartiennent.

Ils offrent également aux chercheurs citoyens de précieuses opportunités d’observer et de se connecter à la biodiversité locale, et les données générées sont de plus en plus intégrées dans la recherche écologique, systématique et de conservation.

En plus des initiatives de numérisation à grande échelle, les musées et les herbiers font souvent appel à des chercheurs citoyens pour transcrire les balises des collections historiques, dont beaucoup sont manuscrites pour être numérisées.

La numérisation des données des spécimens permet de créer des liens passionnants et durables entre les collectionneurs de plantes, les spécimens qu’ils collectent et la recherche basée sur ces spécimens.

Pour témoigner de la valeur durable de ces ressources, les spécimens d’herbier de HB Williamson collectés entre 1882 et 1931 ont été intégrés à la recherche et cités dans cinq éditions en 2022, selon les données enregistrées dans le référentiel en ligne Bionomia.

Partout au pays, des chercheurs, des conservateurs et des chercheurs citoyens recherchent et conservent les précieux atouts de nos collections d’histoire naturelle. Ces efforts garantiront que les spécimens au cœur de cette infrastructure de recherche critique sont bien conservés et disponibles à jamais pour la recherche et la détection.


Les spécimens de plantes fournissent des données puissantes sur la vie dans l’anthropocène


Offert par l’Université de Melbourne

Devis: Découverte de nouvelles espèces végétales et fongiques (2022, 22 juin) recherché le 22 juin 2022 sur https://phys.org/news/2022-06-fungi-species.html

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